2016年1月，我市将沿湖3县（区）涉及沿湖区域的行政、经济、社会事务整体委托澄江县统一管理。经过职能调整，市抚仙湖管理局直接管理“三湖”，形成了省市共管、以市为主的保护治理体制，湖泊统管统治统保护新格局初步形成。

2018年，我市调整优化“三湖”管理体制机制，整合水资源保护治理的领导决策职责，统一交由河（湖）长制领导小组负责；将河（湖）长制纳入全市“七位一体”责任制，形成“6+4”制度体系，推动河（湖）长制从“有名”向“有实”转变。

良好的生态环境是最普惠的民生福祉。“十三五”期间，我市完善考核奖惩机制，大幅降低沿湖县（市、区）GDP考核权重，切实践行习近平总书记“绿水青山就是金山银山”的绿色发展理念，坚持生态引领，把生态惠民、生态利民、生态为民落到实处，同时激发了广大群众爱湖护湖的热情。持续开展“高原湖泊卫士”行动，建立功能型党组织44个，引导各级党组织和党员争当“五个先锋”。在抚仙湖周边学校持续开展“小手拉大手”湖泊保护行动，推动形成全民参与、全民有责的保护治理格局。